近日，浙江大学医学院附属第一医院，江苏常州武进人民医院，同济大学附属第十人民医院及杭州度安医学检验实验室等共同合作的论文"A proteomic classifier panel for early screening of colorectal cancer: a case control study"（基于蛋白组学的标志物组合用于结直肠癌早期筛查 : 病例对照研究）发表在SCI杂志《Journal of Translational Medicine》（IF: 8.44）上，杭州度安医学检验实验室为共同通讯作者单位。
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PART/ 01 文章背景
结直肠癌（CRC）是常见的恶性肿瘤。在我国，CRC的发病率和死亡率在所有癌症中排名前三位。CRC患者的预后普遍较差，这在很大程度上是由于缺乏有效的检测方法来检测早期肿瘤。尽管基因组学和蛋白质组学领域的技术发展已经确定了一些用于无创筛查和诊断的候选生物标志物，但开发更敏感、更具特异性、成本效益更高且患者依从性更好的方法对于帮助患者对抗该疾病具有巨大潜力。
PART/ 02 研究方法
研究者纳入了3组共479名受试者，包括226例结直肠癌（CRC）病例，197例健康对照，和56例进展期癌前病变（APC）患者。在发现阶段，我们同时采用数据依赖采集（DDA）和数据非独立采集（DIA）两种定量质谱模式来分析为CRC和APC的患者以及健康对照组的血浆蛋白质组，结合两种模式下所获得血浆蛋白质组的分布，并通过机器语言学习的方式找到特征的血浆蛋白组合。针对7个特征蛋白，我们开发了高通量的MRM检测方法来测定血浆的蛋白浓度，并采用逻辑回归的方法建立分类诊断模型来区分结直肠癌、良性息肉和健康受试者。最后使用两个独立的队列进一步验证了该分类模型。
PART/ 03 研究结果
7个蛋白组包括富含亮氨酸的α -2糖蛋白1 (LRG1)、补体C9 (C9)、胰岛素样生长因子结合蛋白2 (IGFBP2)、肌肽二肽酶1 (CNDP1)、α -胰蛋白酶间抑制剂重链3 (ITIH3)、SERPINA1家族成员1 (SERPINA1)和α -1-酸性糖蛋白1 (ORM1)。该组合对CRC和健康受试者的准确率较高，因为训练和测试队列的ROC曲线下面积(AUC)分别达到0.954和0.958。两个独立验证队列的AUC分别为0.905和0.909。在一个验证队列中，该小组的总体敏感性、特异性、阳性预测值(PPV)和阴性预测值(NPV)分别为89.9%、81.8%、89.2%和82.9%。在另一个盲样验证队列中，该小组对健康受试者和CRC进行分类，敏感性为81.5%，特异性为97.9%，总体准确性为92.0%。最后，该组合能够以49%的灵敏度检测APC。
PART/ 04 结论
我们开发了一种无创、靶向质谱分析方法，通过测量血浆中7个蛋白质的浓度，能够有效区分早期结直肠癌及健康受试者。这种基于血浆蛋白组合的诊断方法具有潜在的转化价值，值得进一步开发成为一种临床诊断方法。
文献地址：
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38383428/
