近日，华东师范大学、上海交通大学、加利福尼亚大学圣地亚哥分校、郑州大学附属第一医院、复旦大学和杭州度安医学检验实验室等共同合作的论文"Integrated proteome and phosphoproteome analysis of gastric adenocarcinoma reveals molecular signatures capable of stratifying patient outcome"（蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学整合分析揭示胃腺癌患者的分子特征及分型）发表在 SCI 杂志《Molecular Oncology》（IF:7.449）上。
文章摘要
癌转移是胃癌患者生存率低的主要原因之一。本研究通过探索胃腺癌（GAC）关键蛋白寻找潜在生物标志物为患者的预后和干预治疗提供思路。我们通过定量蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析胃癌淋巴结转移(LMN)和无淋巴结转移患者的肿瘤组织。然后，对其蛋白组进行了整合分析和转录组数据，以揭示其分子特征。本研究定量分析了5536种蛋白，发现LMN患者的218种蛋白表达上调，49种蛋白表达下调。聚类分析发现多种已证实在胃癌中发挥重要作用的中枢蛋白。同时还发现两种细胞外蛋白TNXB和SPON1在LNM患者中过度表达,且与GAC患者生存率低相关。通过WB和免疫组化分析同样证实TNXB和SPON1的过度表达。此外，体外实验发现，用抗TNXB抗体可显著减少胃癌细胞转移。最后，通过定量磷酸化蛋白质组学结合基于捕获活性激酶分析发现，LNM患者原发性肿瘤组织中的激酶GSK3可能是值得进一步研究对象。结论，本研究发现GAC肿瘤可能会发生转移的组织蛋白质组和磷酸化蛋白质组学分析，并成功识别潜在的生物标志物，可用于GAC患者的预后和干预治疗。
文章来源
Lu X, Fu Y, Gu L, Zhang Y, Liao AY, Wang T, Jia B, Zhou D, Liao L. Integrated proteome and phosphoproteome analysis of gastric adenocarcinoma reveals molecular signatures capable of stratifying patient outcome. Mol Oncol. 2022 Dec 15.
